Florian Heidel war in Jena zuletzt fünf Jahre stellvertretender Direktor der Hämatologie und Onkologie, und somit also zuständig für Krankheiten des Blutes und der blutbildenden Organe sowie für Krebserkrankungen. Vorher war er an der Harvard University in Boston und als Oberarzt am Universitätsklinikum Magdeburg tätig, nachdem er Studium und Promotion in seiner Geburtsstadt Erlangen und seine Facharztausbildung am Universitätsklinikum in Mainz abgeschlossen hatte. Florian Heidel ist verheiratet und hat drei Kinder.
Sein klinisches und wissenschaftliches Spezialgebiet ist die Bekämpfung bösartiger Knochenmarkserkrankungen, und hier speziell der sogenannten myeloproliferativen Neoplasien (MPN) und akuten Leukämien. Er ist einer der Sprecher der deutschen MPN-Studiengruppe sowie Mitglied des Fachkollegiums und Gutachter der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) und der Deutschen Krebshilfe e.V.
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